Course: Chimie organique bio-orientée

Section outline

Select section General

Collapse Expand
General

Collapse all Expand all
- Select activity Notes du cours
  
  Notes du cours File
- Select activity Dias
  
  Dias File
- Select activity Tables de référence
  
  Tables de référence File
- Select activity Horaire
  
  Horaire Page
- Select activity Examen
  
  Examen Page
- Select activity COCKPIT : Interactive learning platform
  
  COCKPIT : Interactive learning platform URL
- Select activity ChemDoodle license site (Unil + EPFL)
  
  ChemDoodle license site (Unil + EPFL) URL
Select section Spectrométrie de masse

Collapse Expand
Spectrométrie de masse
- Select activity Outils de calculs théoriques
  
  Outils de calculs théoriques URL
  
  Vous pouvez tester l'outil permettant de calculer une distribution isotopique au départ de n'importe quelle formule brute.
- Select activity Exercices semaines 1 et 2
  
  Exercices semaines 1 et 2 URL
  
  Il y a 3 séries d'exercices pour ces 2 premières semaines:
- Select activity Fin des exercises semaine 1 et 2
  
  Fin des exercises semaine 1 et 2
- Select activity Détermination de la formule brute au départ d'une masse monoisotopique
  
  Détermination de la formule brute au départ d'une masse monoisotopique URL
  
  Vous pouvez tester l'outil permettant de retrouver une formule brute au départ d'une masse monoisotopique
- Select activity Exercices semaines 1 et 2 (copy)
  
  Exercices semaines 1 et 2 (copy) URL
  
  Pour les semaines 3 et 4 il faut réaliser l'exercice intégré.
Select section Degré d'insaturation et isomères de structure

Collapse Expand
Degré d'insaturation et isomères de structure
- Select activity Degree of unsaturation from the chemical structure
  
  Degree of unsaturation from the chemical structure URL
- Select activity Degree of unsaturation from the molecular formula
  
  Degree of unsaturation from the molecular formula URL
- Select activity Structural isomers
  
  Structural isomers URL
- Select activity Fin des exercises semaine 3 et 4
  
  Fin des exercises semaine 3 et 4
Select section Spectroscopie infrarouge

Collapse Expand
Spectroscopie infrarouge
- Select activity Search and compare experimental infrared spectra
  
  Search and compare experimental infrared spectra URL
- Select activity Exercise: Determine the structure of small molecules from infrared spectrum
  
  Exercise: Determine the structure of small molecules from infrared spectrum URL
Select section Diastereotopicity

Collapse Expand
Diastereotopicity
- Select activity Tool : Explore diastereotopic protons
  
  Tool : Explore diastereotopic protons URL
- Select activity Exercise : How many kinds of proton
  
  Exercise : How many kinds of proton URL
- Select activity Fin des exercises semaine 5 et 6
  
  Fin des exercises semaine 5 et 6
Select section Spectroscopie RMN - Différents outils

Collapse Expand
Spectroscopie RMN - Différents outils
- Select activity Tool : Predict 1H NMR spectra
  
  Tool : Predict 1H NMR spectra URL
- Select activity Tool : Simulate multiplet
  
  Tool : Simulate multiplet URL
- Select activity Tool : Simulation - Second order effect (optional)
  
  Tool : Simulation - Second order effect (optional) URL
- Select activity Tool : Browse experimental NMR spectra
  
  Tool : Browse experimental NMR spectra URL
Select section Spectroscopie RMN - Exercices

Collapse Expand
Spectroscopie RMN - Exercices
- Select activity Exercise : NMR of solvents and simple molecules using NMRium
  
  Exercise : NMR of solvents and simple molecules using NMRium URL
- Select activity Exercise : Determine structure from predicted 1H NMR using NMRium
  
  Exercise : Determine structure from predicted 1H NMR using NMRium URL
- Select activity Exercise : More exercises using NMRium
  
  Exercise : More exercises using NMRium URL
- Select activity Exercise : Integrated exercises
  
  Exercise : Integrated exercises URL
Select section Spectres RMN d'acides aminés

Collapse Expand
Spectres RMN d'acides aminés
- Select activity Exercise: NMR spectra of amino acids
  
  Exercise: NMR spectra of amino acids URL
- Select activity Fin des exercises semaine 7 et 8
  
  Fin des exercises semaine 7 et 8
Select section Synthèse peptidique

Collapse Expand
Synthèse peptidique
- Select activity Synthèse peptidique - Niveau 1
  
  Synthèse peptidique - Niveau 1 Quiz
- Select activity Synthèse peptidique - Niveau 2
  
  Synthèse peptidique - Niveau 2 Quiz
- Select activity Synthèse peptidique - Niveau 3
  
  Synthèse peptidique - Niveau 3 Quiz
- Select activity Fin des exercises semaine 9 et 10
  
  Fin des exercises semaine 9 et 10
Select section JSMol et Applications

Collapse Expand
JSMol et Applications

Current week
Select section Travail sur une protéine

Collapse Expand
Travail sur une protéine
Travail à présenter le 13 ou 20 décembre 2024 !

1. Choix d'une protéine

Choisir une protéine dans la pdb (http://www.pdb.org) qui remplit les conditions suivantes:

Contient un inhibiteur ou substrat (on doit analyser l'interaction entre 2 molécules)

Contient au moins une hélice

Contient au moins un feuillet béta

Afin de vous faciliter le travail nous avons préselectionné une liste de protéine candidates.

Vous pouvez tester JsMol en utilisant le cliquant ici.

2. Analyse de la protéine

Voir la desciption détaillée sur:

https://docs.google.com/document/d/1Go08J2-dEq1JPgrHD5BZRjXwRGgZhvyY0WW3cz7IBgM/edit?usp=sharing
Select section Corrigés

Collapse Expand
Corrigés
- Select activity Corrigé_Peptides_1
  
  Corrigé_Peptides_1 File
- Select activity Corrigé_Peptides_2
  
  Corrigé_Peptides_2 File
- Select activity Corrigé_Peptides_3
  
  Corrigé_Peptides_3 File
Select section 23 November - 29 November

Collapse Expand
23 November - 29 November
Select section 30 November - 6 December

Collapse Expand
30 November - 6 December
Select section 7 December - 13 December

Collapse Expand
7 December - 13 December
Select section 14 December - 20 December

Collapse Expand
14 December - 20 December

Section outline

Travail à présenter le 13 ou 20 décembre 2024 !

1. Choix d'une protéine

2. Analyse de la protéine